Геолошки састав, са добрим делом непропусних стена, у комбинацији са релативно великом количином падавина, уз разуђеност рељефа, битно утиче на богату водну карту Јошаничке Бање. У сливу реке Јошанице налази се двадесетак извора хладне воде са издашношћу до 1 l/sec. Каптажом четири извора са Кокоровца решено је водоснабдевање Јошаничке Бање.

Јошаничка река извире на висини од 1.560 m, из мањег језера испод планине Жељин. Дуга је 39 km, до ушћа у Ибар, веома је брза и хладна планинска река у горњем току, док у средњем току температуру повећавају топли извори у Јошаничкој Бањи. Површина богатог слива Јошанице је 265 km² са 141 притоком. Воде ове реке богате су поточном пастрмком и младицом.

Река Самоковка је лева притока Јошаничке реке, извире на 1.900 m надморске висине и затим протиче кроз Равни Копаоник. У Јошаничкој Бањи се улива у Јошаничку реку, има ток дужине 11 km и површину слива од 52 km².

Међу изворима у сливу Јошанице најпознатији су термални извори Јошаничке Бање. Са температуром воде од 77ºC она представља другу бању у Србији по термалности. Бањско окружење има шеснаест извора ниско минерализоване (320 mg/l) термалне воде на три локације. Главно извориште је у самом насељу са леве стране Јошанице са 11 извора. Друго, много слабије је на десној страни реке и састоји се од 3 извора, и треће, Сланиште, на удаљености од 1.850 m од центра бање, низводно реком Јошаницом. Највећу издашност има група топлих извора која се налази на левој тераси Јошанице, у парку самог центра насеља. На 500 m узводно од центра бање налази се Лушки поток, извор хладне гвожђевито-угљенокиселе воде (14ºC) и издашности 0,08 l/s.